Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB27AP51159 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms