Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPFP49454 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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CENPFP49454 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPFP49454 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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