Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTAP49354 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms