Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX1P48742 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX1P48742 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms