Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 ACSL6-204ENST00000379244 2658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 MPP4-201ENST00000315506 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 MPP4-207ENST00000428900 2320 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 ITGBL1-205ENST00000545560 4808 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CAPN9-201ENST00000271971 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 IL16-203ENST00000394652 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CDKN2B-AS1-203ENST00000428597 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 SPDYE16-202ENST00000632547 3434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PCP4P48539 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 C1orf94-202ENST00000488417 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 TMCO4-201ENST00000294543 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 SCARA3-201ENST00000301904 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 DAPK2-201ENST00000261891 2603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 EXD2-206ENST00000409949 2688 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 RPS15A-201ENST00000322989 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 SAMMSON-206ENST00000641053 1516 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 SLC6A12-201ENST00000359674 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 RPS6KA2-206ENST00000503859 4137 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 DNAJC2-204ENST00000412522 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 LACC1-203ENST00000441843 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 PAMR1-205ENST00000611014 2613 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PCP4P48539 ZPLD1-204ENST00000491959 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PCP4P48539 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PCP4P48539 AP3B2-215ENST00000620652 3729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PCP4P48539 RANGAP1-202ENST00000405486 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PCP4P48539 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PCP4P48539 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PCP4P48539 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PCP4P48539 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms