Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms