Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALDH1A3P47895 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALDH1A3P47895 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms