Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UTRNP46939 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UTRNP46939 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTRNP46939 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTRNP46939 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms