Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RECQLP46063 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RECQLP46063 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms