Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSOP43234 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSOP43234 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSOP43234 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSOP43234 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms