Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPA9P38646 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms