Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNB1P35222 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms