Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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