Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCAP28676 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCAP28676 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms