Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLD1P28340 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms