Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PLNP26678 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PLNP26678 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PLNP26678 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms