Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT1P26358 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms