Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRGP23470 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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