Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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