Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PTPRBP23467 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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PTPRBP23467 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PTPRBP23467 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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PTPRBP23467 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PTPRBP23467 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PTPRBP23467 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PTPRBP23467 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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