Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms