Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATF6P18850 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATF6P18850 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATF6P18850 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATF6P18850 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATF6P18850 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATF6P18850 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms