Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VCLP18206 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VCLP18206 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms