Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XBP1P17861 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XBP1P17861 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XBP1P17861 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XBP1P17861 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms