Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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