Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PRF1P14222 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms