Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSLP07711 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms