Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EDN1P05305 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EDN1P05305 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms