Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC24BO95487 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms