Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJB6O95452 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJB6O95452 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJB6O95452 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJB6O95452 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms