Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PMPCBO75439 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms