Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR5O60602 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR5O60602 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms