Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREB3O43889 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREB3O43889 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms