Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms