Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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HOXC11O43248 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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HOXC11O43248 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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HOXC11O43248 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC11O43248 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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HOXC11O43248 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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HOXC11O43248 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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HOXC11O43248 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC11O43248 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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