Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms