Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms