Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FRMD4BQ9Y2L6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms