Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms