Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms