Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD1Q9UIS9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms