Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLKQ9UBT6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms