Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms