Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRP2BPQ9P2M1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRP2BPQ9P2M1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms