Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms