Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
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