Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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GIN1Q9NXP7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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