Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms