Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL6Q9BWW8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms