Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms